FHIR データに連携しTalend からデータに接続

こんにちは！ドライバー周りのヘルプドキュメントを担当している古川です。

この記事では、Talend で簡単にCData JDBC Driver for FHIR をワークフローに統合してFHIR データ連携する方法を説明します。ここではCData JDBC Driver for FHIR を使ってTalend でFHIR をジョブフローに転送します。

JDBC データソースとしてTalend でFHIR に接続

下記の手順に従って、FHIR にJDBC 接続を確立します：

1. FHIR を新しいデータベース接続を追加：新しく接続を追加するには、［Metadata］ノードを展開し［Db Connections］ノードを右クリックして［Create Connection］をクリックします。
2. ウィザードが表示されたら、接続に名前を入力します。

3. 次のページで、［DB Type］メニューから［Generic JDBC］を選択してJDBC URL を入力します。

   URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

   汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

   Service Base URL のサンプル

   • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
   • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
   • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
   • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

   汎用FHIR インスタンス

   CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

   以下は一般的なJDBC URL です：

   jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;
4. インストールディレクトリの［lib］サブフォルダ内にあるcdata.jdbc.fhir.jar ファイルへのパスを入力します。
5. 接続を右クリックして［Retrieve Schema］をクリックします。
6. デフォルトオプションで［Next］をクリックしインポートしたいテーブルを選択します。
7. デフォルトオプションでウィザードを終了します。

Patient テーブルをフラットファイルに出力

下記の手順に従って、Patient テーブルをフラットファイル出力コンポーネントに転送します：

1. ［Table Schemas］ノードで、テーブルをワークスペース内にドラッグします。
2. ダイアログが表示されたら［tJDBCInput］コンポーネントを選択します。
3. 次に、［tFileOutputDelimited］コンポーネントをPalette の［Business Intelligence］タブからワークスペース内にドラッグします。
4. Patient tJDBCInput コンポーネントを右クリックしてベクタを出力ファイルにドラッグします。

プロジェクトを実行してデータを転送します。