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Greenplum データをR で分析

CData JDBC Driver for Greenplumで標準的なR 関数とお好みの開発環境を使って、 Greenplum を分析。



Pure R スクリプトおよび 標準SQL を使って、R およびJava をインストール可能なあらゆるマシン上でGreenplum にアクセス。CData JDBC Driver for Greenplum とRJDBC package を使って、R でリモートGreenplum data を利用できます。CData Driver を使うことで、業界が認めた基準で書かれたドライバーを活用して、オープンソースでポピュラーなR 言語のデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってGreenplum にSQL クエリを実行する方法、および標準R 関数を呼び出してGreenplum をビジュアライズする方法について説明します。

R をインストール

マルチスレッドのMicrosoft R Open を実行すること、またはBLAS/LAPACK ライブラリにリンクされたオープン R を実行することによって、マルチスレッドおよびマネージドコードから利益を得られたドライバーのパフォーマンスにマッチできます。ここでは、Microsoft R Open 3.2.3 を使用します。CRAN レポジトリのJan. 1, 2016 snapshot からパッケージをインストールするために事前設定されています。このsnapshot は再現性を保証します。

RJDBC パッケージをロード

ドライバーを使うにはRJDBC パッケージをダウンロードします。RJDBC パッケージをインストールしたら、次のコードを入力してパッケージをロードします。

library(RJDBC)

JDBC データソースとしてGreenplum に接続

下記の情報を使いGreenplum にJDBC データソースとして接続します。

  • Driver Class:cdata.jdbc.greenplum.GreenplumDriver に設定。
  • Classpath:Driver JAR の場所を設定します。デフォルトではインストールディレクトリの[lib]サブフォルダです。

dbConnect やdbSendQuery のようなDBI 関数は、R にデータアクセスコードを書くための統一インターフェースを提供します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.greenplum.GreenplumDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.greenplum.jar", identifier.quote = "'")

これで、DBI 関数を使ってGreenplum に接続しSQL クエリを実行する準備が整いました。dbConnect 関数を使ってJDBC 接続を初期化します。一般的なJDBC 接続文字列は次のとおりです。

conn <- dbConnect(driver,"User=user;Password=admin;Database=dbname;Server=127.0.0.1;Port=5432;")

Greenplum に接続するには、Server、Port (デフォルトポートは5432)、およびDatabase 接続プロパティを設定して、サーバーへの認証に使用するUser とPassword を設定します。Database プロパティが指定されていない場合、本製品はユーザーのデフォルトデータベース(ユーザーと同じ名前になります)に接続します。

スキーマ Discovery

ドライバーはGreenplum API をリレーショナルデータベース、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデルします。次のコードを使ってテーブルリストを検出します。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使ってGreenplum API がサポートするすべてのSQL クエリを実行できます:

orders <- dbGetQuery(conn,"SELECT Freight, ShipName FROM Orders WHERE ShipCountry = USA")

次のコマンドを使って、結果を[data viewer]ウィンドウで見ることができます。

View(orders)

Greenplum Data をプロット

CRAN レポジトリで利用可能なあらゆるデータ初期化パッケージを使ってGreenplum を分析する準備が整いました。ビルトインバーのplot 関数を使って簡単なバーを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(orders$ShipName, main="Greenplum Orders", names.arg = orders$Freight, horiz=TRUE)
 
 
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