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Spark データをR で分析

CData JDBC Driver で標準的なR 関数とお好みの開発環境を使ってSpark を分析。

加藤龍彦
デジタルマーケティング

最終更新日:2023-09-21
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CData

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こんにちは!ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。

Pure R スクリプトおよび 標準SQL を使って、R およびJava をインストール可能なあらゆるマシン上でSpark にアクセス。CData JDBC Driver for SparkSQL とRJDBC package を使って、R でリモートSpark データ を利用できます。CData Driver を使うことで、業界が認めた基準で書かれたドライバーを活用して、オープンソースでポピュラーなR 言語のデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってSpark にSQL クエリを実行する方法、および標準R 関数を呼び出してSpark をビジュアライズする方法について説明します。

R をインストール

マルチスレッドのMicrosoft R Open を実行すること、またはBLAS/LAPACK ライブラリにリンクされたオープン R を実行することによって、マルチスレッドおよびマネージドコードから利益を得られたドライバーのパフォーマンスにマッチできます。ここでは、Microsoft R Open 3.2.3 を使用します。CRAN レポジトリのJan. 1, 2016 snapshot からパッケージをインストールするために事前設定されています。このsnapshot は再現性を保証します。

RJDBC パッケージをロード

ドライバーを使うにはRJDBC パッケージをダウンロードします。RJDBC パッケージをインストールしたら、次のコードを入力してパッケージをロードします。

library(RJDBC)

JDBC データソースとしてSpark に接続

下記の情報を使いSpark にJDBC データソースとして接続します。

  • Driver Class:cdata.jdbc.sparksql.SparkSQLDriver に設定。
  • Classpath:Driver JAR の場所を設定します。デフォルトではインストールディレクトリの[lib]サブフォルダです。

dbConnect やdbSendQuery のようなDBI 関数は、R にデータアクセスコードを書くための統一インターフェースを提供します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.sparksql.SparkSQLDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.sparksql.jar", identifier.quote = "'")

これで、DBI 関数を使ってSpark に接続しSQL クエリを実行する準備が整いました。dbConnect 関数を使ってJDBC 接続を初期化します。一般的なJDBC 接続文字列は次のとおりです。

conn <- dbConnect(driver,"Server=127.0.0.1;")

SparkSQL への接続

SparkSQL への接続を確立するには以下を指定します。

  • Server:SparkSQL をホストするサーバーのホスト名またはIP アドレスに設定。
  • Port:SparkSQL インスタンスへの接続用のポートに設定。
  • TransportMode:SparkSQL サーバーとの通信に使用するトランスポートモード。有効な入力値は、BINARY およびHTTP です。デフォルトではBINARY が選択されます。
  • AuthScheme:使用される認証スキーム。有効な入力値はPLAIN、LDAP、NOSASL、およびKERBEROS です。デフォルトではPLAIN が選択されます。

Databricks への接続

Databricks クラスターに接続するには、以下の説明に従ってプロパティを設定します。Note:必要な値は、「クラスター」に移動して目的のクラスターを選択し、 「Advanced Options」の下にある「JDBC/ODBC」タブを選択することで、Databricks インスタンスで見つけることができます。

  • Server:Databricks クラスターのサーバーのホスト名に設定。
  • Port:443
  • TransportMode:HTTP
  • HTTPPath:Databricks クラスターのHTTP パスに設定。
  • UseSSL:True
  • AuthScheme:PLAIN
  • User:'token' に設定。
  • Password:パーソナルアクセストークンに設定(値は、Databricks インスタンスの「ユーザー設定」ページに移動して「アクセストークン」タブを選択することで取得できます)。

スキーマ Discovery

ドライバーはSpark API をリレーショナルデータベース、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデルします。次のコードを使ってテーブルリストを検出します。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使ってSpark API がサポートするすべてのSQL クエリを実行できます:

customers <- dbGetQuery(conn,"SELECT City, Balance FROM Customers")

次のコマンドを使って、結果を[data viewer]ウィンドウで見ることができます。

View(customers)

Spark データ をプロット

CRAN レポジトリで利用可能なあらゆるデータ初期化パッケージを使ってSpark を分析する準備が整いました。ビルトインバーのplot 関数を使って簡単なバーを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(customers$Balance, main="Spark Customers", names.arg = customers$City, horiz=TRUE) A basic bar plot. (Salesforce is shown.)

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