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Athena Data をR で分析

CData JDBC Driver for Athenaで標準的なR 関数とお好みの開発環境を使って、 Athena data を分析。



Pure R スクリプトおよび 標準SQL を使って、R およびJava をインストール可能なあらゆるマシン上でAthena data にアクセス。CData JDBC Driver for Athena とRJDBC package を使って、R でリモートAthena data を利用できます。CData Driver を使うことで、業界が認めた基準で書かれたドライバーを活用して、オープンソースでポピュラーなR 言語のデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってAthena にSQL クエリを実行する方法、および標準R 関数を呼び出してAthena data をビジュアライズする方法について説明します。

R をインストール

マルチスレッドのMicrosoft R Open を実行すること、またはBLAS/LAPACK ライブラリにリンクされたオープン R を実行することによって、マルチスレッドおよびマネージドコードから利益を得られたドライバーのパフォーマンスにマッチできます。ここでは、Microsoft R Open 3.2.3 を使用します。CRAN レポジトリのJan. 1, 2016 snapshot からパッケージをインストールするために事前設定されています。このsnapshot は再現性を保証します。

RJDBC パッケージをロード

ドライバーを使うにはRJDBC パッケージをダウンロードします。RJDBC パッケージをインストールしたら、次のコードを入力してパッケージをロードします。

library(RJDBC)

JDBC データソースとしてAthena に接続

下記の情報を使いAthena にJDBC データソースとして接続します。

  • Driver Class:cdata.jdbc.amazonathena.AmazonAthenaDriver に設定。
  • Classpath:Driver JAR の場所を設定します。デフォルトではインストールディレクトリの[lib]サブフォルダです。

dbConnect やdbSendQuery のようなDBI 関数は、R にデータアクセスコードを書くための統一インターフェースを提供します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.amazonathena.AmazonAthenaDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.amazonathena.jar", identifier.quote = "'")

これで、DBI 関数を使ってAthena に接続しSQL クエリを実行する準備が整いました。dbConnect 関数を使ってJDBC 接続を初期化します。一般的なJDBC 接続文字列は次のとおりです。

conn <- dbConnect(driver,"AccessKey='a123';SecretKey='s123';Region='IRELAND';Database='sampledb';S3StagingDirectory='s3://bucket/staging/';")

Authenticating to Amazon Athena

To authorize Amazon Athena requests, provide the credentials for an administrator account or for an IAM user with custom permissions: Set AccessKey to the access key Id. Set SecretKey to the secret access key.

Note: Though you can connect as the AWS account administrator, it is recommended to use IAM user credentials to access AWS services.

Obtaining the Access Key

To obtain the credentials for an IAM user, follow the steps below:

  1. Sign into the IAM console.
  2. In the navigation pane, select Users.
  3. To create or manage the access keys for a user, select the user and then select the Security Credentials tab.

To obtain the credentials for your AWS root account, follow the steps below:

  1. Sign into the AWS Management console with the credentials for your root account.
  2. Select your account name or number and select My Security Credentials in the menu that is displayed.
  3. Click Continue to Security Credentials and expand the Access Keys section to manage or create root account access keys.

Authenticating from an EC2 Instance

If you are using the CData Data Provider for Amazon Athena 2018 from an EC2 Instance and have an IAM Role assigned to the instance, you can use the IAM Role to authenticate. To do so, set UseEC2Roles to true and leave AccessKey and SecretKey empty. The CData Data Provider for Amazon Athena 2018 will automatically obtain your IAM Role credentials and authenticate with them.

Authenticating as an AWS Role

In many situations it may be preferable to use an IAM role for authentication instead of the direct security credentials of an AWS root user. An AWS role may be used instead by specifying the RoleARN. This will cause the CData Data Provider for Amazon Athena 2018 to attempt to retrieve credentials for the specified role. If you are connecting to AWS (instead of already being connected such as on an EC2 instance), you must additionally specify the AccessKey and SecretKey of an IAM user to assume the role for. Roles may not be used when specifying the AccessKey and SecretKey of an AWS root user.

Authenticating with MFA

For users and roles that require Multi-factor Authentication, specify the MFASerialNumber and MFAToken connection properties. This will cause the CData Data Provider for Amazon Athena 2018 to submit the MFA credentials in a request to retrieve temporary authentication credentials. Note that the duration of the temporary credentials may be controlled via the TemporaryTokenDuration (default 3600 seconds).

Connecting to Amazon Athena

In addition to the AccessKey and SecretKey properties, specify Database, S3StagingDirectory and Region. Set Region to the region where your Amazon Athena data is hosted. Set S3StagingDirectory to a folder in S3 where you would like to store the results of queries.

If Database is not set in the connection, the data provider connects to the default database set in Amazon Athena.

スキーマ Discovery

ドライバーはAthena API をリレーショナルデータベース、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデルします。次のコードを使ってテーブルリストを検出します。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使ってAthena API がサポートするすべてのSQL クエリを実行できます:

customers <- dbGetQuery(conn,"SELECT Name, TotalDue FROM Customers")

次のコマンドを使って、結果を[data viewer]ウィンドウで見ることができます。

View(customers)

Athena Data をプロット

CRAN レポジトリで利用可能なあらゆるデータ初期化パッケージを使ってAthena data を分析する準備が整いました。ビルトインバーのplot 関数を使って簡単なバーを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(customers$TotalDue, main="Athena Customers", names.arg = customers$Name, horiz=TRUE)
 
 
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