FHIR をSSIS 経由でSQL サーバーにバックアップする

こんにちは！ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。

FHIR 用のCData ADO.NET プロバイダーはFHIR をバックアップ、レポート、フルテキスト検索、分析などを行うアプリケーションに接続します。

ここでは、SQL サーバー SSIS ワークフロー内でFHIR 用のプロバイダーを使用して、FHIR をMicrosoft SQL サーバーデータベースに直接転送する方法を説明します。 以下のアウトラインと同じ手順を、CData ADO.NET データプロバイダーにて使用することで、SSIS 経由でSQL サーバーを直接リモートデータに接続できます。

1. Visual Studio を開き、新しいIntegration サービスプロジェクトを追加します。
2. ツールボックスからControl Flow 画面へ、新しいData Flow タスクを追加します。

3. Data Flow 画面で、ツールボックスから［ADO.NET Source］ と［OLE DB Destination］ を追加します。

4. 新しい接続を追加し、FHIR 2015 用の .NET プロバイダー\CData ADO.NET プロバイダーを選択します。

5. Connection Manager で、FHIR 用に接続の詳細を入力します。下は一般的な接続文字列です。

   URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;

   URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

   汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

   Service Base URL のサンプル

   • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
   • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
   • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
   • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

   汎用FHIR インスタンス

   CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

6. DataReader editor を開き、次のインフォメーションを設定します。

   • ADO.NET 接続マネージャー：Connection Manager のメニューで、先ほど作成した［Data Connection］ を選択します。
   • データアクセスモード：［SQL command］ を選択します。
   • SQL command テキスト：DataReader Source editor で、Component Properties タブを開き、下にあるようなSELECT command を入力します。
     SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'

7. DataReader editor を閉じ、DataReader Source の下の矢印をドラッグして、OLE DB Destination に接続します。

8. OLE DB Destination を開き、Destination Component Editor で次のインフォメーションを入力します。

   • コネクションマネージャー：新しい接続を追加します。接続するサーバーおよびデータベースの情報を入力します。ここでは、SQLExpress は他のマシンで運用中です。
   • データアクセスモード：データアクセスモードを［table or view］ に設定し、データベースに入力するテーブルまたはビューを選択します。

9. Mappings 画面で必要なプロパティを設定します。

10. OLE DB Destination Editor を閉じ、プロジェクトを始動します。SSIS タスクの実行が完了すれば、 FHIR から取得したデータが、データベースに入力されます。