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Birst でFHIR データ のビジュアライゼーションを構築
CData JDBC Driver とBirst クラウドエージェントを使用して、Birst でFHIR のデータ のリアルタイムの視覚化を構築します。
最終更新日：2021-10-31
この記事で実現できるFHIR 連携のシナリオ
こんにちは！ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。
Birst は、組織が複雑なプロセスを迅速に理解し、最適化することを支援するクラウドビジネスインテリジェンス（BI）ツールおよび分析プラットフォームです。CData JDBC Driver for FHIR と組み合わせると、Birst Cloud Agent を経由してリアルタイムFHIR のデータ に接続し、ビジュアライズを構築できます。ここでは、Cloud Agent を使用してFHIR に連携し、Birst で動的レポートを作成する方法を段階的に説明します。
強力なデータ処理機能により、CData JDBC Driver はBirst のFHIR のデータ 操作に高いパフォーマンスを提供します。Birst からFHIR への複雑なSQL クエリを発行すると、ドライバーはフィルタや集計などのサポートされているSQL 操作を直接FHIR にプッシュし、組込みSQL エンジンを利用してクライアント側でサポートしない操作を処理します。組み込みの動的メタデータクエリにより、JDBC ドライバーはネイティブのBirst データ型を使用してFHIR のデータ を視覚化および分析することを可能にします。
Birst でFHIR データ へのJDBC 接続を設定
Birst プロジェクトを作成する前に、JDBC Driver を操作するためのBirst Cloud Agent をインストールする必要があります。また、JDBC ドライバーのJAR ファイル(および存在する場合はLIC ファイル)をCloud Agent のインストール場所の/drivers/ ディレクトリにコピーします。
ドライバーとCloud Agent のインストールが完了したら、開始できます。
- Birst で新しいプロジェクトを作成します。
- 接続に名前を付けます。(e.g. CDataFHIR)
- Live Access を選択します。
- エージェントを選択します。
- Database Type をOther に設定します。
- SQL タイプをMSSQL に設定します。
- 接続文字列を設定します。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
- Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
ビルトイン接続文字列デザイナー
JDBC URL の構成については、FHIR JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーを使用してください。JAR ファイルのダブルクリック、またはコマンドラインからJAR ファイルを実行します。
java -jar cdata.jdbc.fhir.jar接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。
JDBC URL を構成する際、Max Rows 接続プロパティを設定することもできます。これによって戻される行数を制限するため、可視化・レポートのデザイン設計時のパフォーマンスを向上させるのに役立ちます。
以下はFHIR の一般的なJDBC 接続文字列です。
jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None; - Driver Name cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver を設定し、［Save］をクリックします。
NOTE FHIR への認証は接続文字列に管理されるため、［Security Credentials］は空白でも問題ありません。
FHIR データ オブジェクトを設定
接続が構成されたら、データセットのスキーマを構成し、ビジュアライズするテーブル、ビュー、そしてカラムを選択することができるようになります。
- スキーマを選択します。 (e.g. FHIR)
- ［Tables］や［Views］をクリックしてこれらのエンティティに接続し、［Apply］をクリックします。
- アクセスする［Tables］と［Columns］を選択し、［Done］をクリックします。
オブジェクトが構成されたら、Pronto Prepare and Relate ツールを用いて、データ準備の実行やデータのリレーションを検出できるようになります。
ビジュアライゼーションを構築
データを準備し、接続されたオブジェクト間のリレーションを定義することで、ビジュアライゼーションを構築することができるようになります。
- メニューから、Visualizer ツールを選択します。
- オブジェクトからMeasures & Categories を選択します。
- 選択したMeasure(s) に適切なビジュアライゼーションを選択し、構成します。
CData JDBC Driver for FHIR をCloud Agent やBirst とともに用いることにより、FHIR で簡単に堅牢なビジュアライゼーションとレポートを作成できます。30日の無償評価版をダウンロードし、Birst ビジュアライゼーションの構築を開始してください。
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