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GitHub データをR で分析

CData JDBC Driver で標準的なR 関数とお好みの開発環境を使ってGitHub を分析。

加藤龍彦
ウェブデベロッパー

最終更新日:2023-09-21
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CData

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こんにちは!ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。

Pure R スクリプトおよび 標準SQL を使って、R およびJava をインストール可能なあらゆるマシン上でGitHub にアクセス。CData JDBC Driver for GitHub とRJDBC package を使って、R でリモートGitHub データ を利用できます。CData Driver を使うことで、業界が認めた基準で書かれたドライバーを活用して、オープンソースでポピュラーなR 言語のデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってGitHub にSQL クエリを実行する方法、および標準R 関数を呼び出してGitHub をビジュアライズする方法について説明します。

R をインストール

マルチスレッドのMicrosoft R Open を実行すること、またはBLAS/LAPACK ライブラリにリンクされたオープン R を実行することによって、マルチスレッドおよびマネージドコードから利益を得られたドライバーのパフォーマンスにマッチできます。ここでは、Microsoft R Open 3.2.3 を使用します。CRAN レポジトリのJan. 1, 2016 snapshot からパッケージをインストールするために事前設定されています。このsnapshot は再現性を保証します。

RJDBC パッケージをロード

ドライバーを使うにはRJDBC パッケージをダウンロードします。RJDBC パッケージをインストールしたら、次のコードを入力してパッケージをロードします。

library(RJDBC)

JDBC データソースとしてGitHub に接続

下記の情報を使いGitHub にJDBC データソースとして接続します。

  • Driver Class:cdata.jdbc.github.GitHubDriver に設定。
  • Classpath:Driver JAR の場所を設定します。デフォルトではインストールディレクトリの[lib]サブフォルダです。

dbConnect やdbSendQuery のようなDBI 関数は、R にデータアクセスコードを書くための統一インターフェースを提供します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.github.GitHubDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.github.jar", identifier.quote = "'")

これで、DBI 関数を使ってGitHub に接続しSQL クエリを実行する準備が整いました。dbConnect 関数を使ってJDBC 接続を初期化します。一般的なJDBC 接続文字列は次のとおりです。

conn <- dbConnect(driver,"OAuthClientId=MyOAuthClientId;OAuthClientSecret=MyOAuthClientSecret;CallbackURL=http://localhost:portNumber;")

GitHub への接続には、OAuth 2 認証標準を使います。OAuth で認証するには、アプリを作成してOAuthClientId、OAuthClientSecret、およびCallbackURL 接続プロパティを取得する必要があります。詳細はヘルプドキュメントの「はじめに」を参照してください。

スキーマ Discovery

ドライバーはGitHub API をリレーショナルデータベース、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデルします。次のコードを使ってテーブルリストを検出します。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使ってGitHub API がサポートするすべてのSQL クエリを実行できます:

users <- dbGetQuery(conn,"SELECT Name, Email FROM Users")

次のコマンドを使って、結果を[data viewer]ウィンドウで見ることができます。

View(users)

GitHub データ をプロット

CRAN レポジトリで利用可能なあらゆるデータ初期化パッケージを使ってGitHub を分析する準備が整いました。ビルトインバーのplot 関数を使って簡単なバーを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(users$Email, main="GitHub Users", names.arg = users$Name, horiz=TRUE) A basic bar plot. (Salesforce is shown.)

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