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PostgreSQL Data をR で分析

CData JDBC Driver for PostgreSQLで標準的なR 関数とお好みの開発環境を使って、 PostgreSQL data を分析。



Pure R スクリプトおよび 標準SQL を使って、R およびJava をインストール可能なあらゆるマシン上でPostgreSQL data にアクセス。CData JDBC Driver for PostgreSQL とRJDBC package を使って、R でリモートPostgreSQL data を利用できます。CData Driver を使うことで、業界が認めた基準で書かれたドライバーを活用して、オープンソースでポピュラーなR 言語のデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってPostgreSQL にSQL クエリを実行する方法、および標準R 関数を呼び出してPostgreSQL data をビジュアライズする方法について説明します。

R をインストール

マルチスレッドのMicrosoft R Open を実行すること、またはBLAS/LAPACK ライブラリにリンクされたオープン R を実行することによって、マルチスレッドおよびマネージドコードから利益を得られたドライバーのパフォーマンスにマッチできます。ここでは、Microsoft R Open 3.2.3 を使用します。CRAN レポジトリのJan. 1, 2016 snapshot からパッケージをインストールするために事前設定されています。このsnapshot は再現性を保証します。

RJDBC パッケージをロード

ドライバーを使うにはRJDBC パッケージをダウンロードします。RJDBC パッケージをインストールしたら、次のコードを入力してパッケージをロードします。

library(RJDBC)

JDBC データソースとしてPostgreSQL に接続

下記の情報を使いPostgreSQL にJDBC データソースとして接続します。

  • Driver Class:cdata.jdbc.postgresql.PostgreSQLDriver に設定。
  • Classpath:Driver JAR の場所を設定します。デフォルトではインストールディレクトリの[lib]サブフォルダです。

dbConnect やdbSendQuery のようなDBI 関数は、R にデータアクセスコードを書くための統一インターフェースを提供します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.postgresql.PostgreSQLDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.postgresql.jar", identifier.quote = "'")

これで、DBI 関数を使ってPostgreSQL に接続しSQL クエリを実行する準備が整いました。dbConnect 関数を使ってJDBC 接続を初期化します。一般的なJDBC 接続文字列は次のとおりです。

conn <- dbConnect(driver,"User=postgres;Password=admin;Database=postgres;Server=127.0.0.1;Port=5432;")

To connect to PostgreSQL, set the Server, Port (the default port is 5432), and Database connection properties and set the User and Password you wish to use to authenticate to the server. If the Database property is not specified, the data provider connects to the user's default database.

スキーマ Discovery

ドライバーはPostgreSQL API をリレーショナルデータベース、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデルします。次のコードを使ってテーブルリストを検出します。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使ってPostgreSQL API がサポートするすべてのSQL クエリを実行できます:

orders <- dbGetQuery(conn,"SELECT ShipName, ShipCity FROM Orders")

次のコマンドを使って、結果を[data viewer]ウィンドウで見ることができます。

View(orders)

PostgreSQL Data をプロット

CRAN レポジトリで利用可能なあらゆるデータ初期化パッケージを使ってPostgreSQL data を分析する準備が整いました。ビルトインバーのplot 関数を使って簡単なバーを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(orders$ShipCity, main="PostgreSQL Orders", names.arg = orders$ShipName, horiz=TRUE)
 
 
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