SAS xpt データをR で分析

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SASxpt JDBC Driver

SAS xpt (XPORT) ファイルデータを組み込んだパワフルなJava アプリケーションを短時間・低コストで作成して配布できます。



CData JDBC Driver for SAS xptで標準的なR 関数とお好みの開発環境を使って、 SAS xpt を分析。



Pure R スクリプトおよび 標準SQL を使って、R およびJava をインストール可能なあらゆるマシン上でSAS xpt にアクセス。CData JDBC Driver for SAS xpt とRJDBC package を使って、R でリモートSAS xpt data を利用できます。CData Driver を使うことで、業界が認めた基準で書かれたドライバーを活用して、オープンソースでポピュラーなR 言語のデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってSAS xpt にSQL クエリを実行する方法、および標準R 関数を呼び出してSAS xpt をビジュアライズする方法について説明します。

R をインストール

マルチスレッドのMicrosoft R Open を実行すること、またはBLAS/LAPACK ライブラリにリンクされたオープン R を実行することによって、マルチスレッドおよびマネージドコードから利益を得られたドライバーのパフォーマンスにマッチできます。ここでは、Microsoft R Open 3.2.3 を使用します。CRAN レポジトリのJan. 1, 2016 snapshot からパッケージをインストールするために事前設定されています。このsnapshot は再現性を保証します。

RJDBC パッケージをロード

ドライバーを使うにはRJDBC パッケージをダウンロードします。RJDBC パッケージをインストールしたら、次のコードを入力してパッケージをロードします。

library(RJDBC)

JDBC データソースとしてSAS xpt に接続

下記の情報を使いSAS xpt にJDBC データソースとして接続します。

  • Driver Class:cdata.jdbc.sasxpt.SASXptDriver に設定。
  • Classpath:Driver JAR の場所を設定します。デフォルトではインストールディレクトリの[lib]サブフォルダです。

dbConnect やdbSendQuery のようなDBI 関数は、R にデータアクセスコードを書くための統一インターフェースを提供します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.sasxpt.SASXptDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.sasxpt.jar", identifier.quote = "'")

これで、DBI 関数を使ってSAS xpt に接続しSQL クエリを実行する準備が整いました。dbConnect 関数を使ってJDBC 接続を初期化します。一般的なJDBC 接続文字列は次のとおりです。

conn <- dbConnect(driver,"URI=C:/folder;")

ローカルSASXpt ファイルへの接続

URI をSASXpt ファイルを格納しているフォルダに設定すると、ローカルのSASXpt ファイルに接続できます。

S3 データソースへの接続

Amazon S3 ソースに接続してSASXpt ファイルを読み込むことができます。以下のプロパティを設定して接続します:

  • URI:接続するバケット内のフォルダに設定。
  • AWSAccessKey:AWS アカウントのアクセスキーに設定。
  • AWSSecretKey:AWS アカウントのシークレットキーに設定。
  • TemporaryLocalFolder:SASXptファイルを一時的にダウンロードするために使用するフォルダへのパス、またはURI に設定。

Azure Data Lake Storage Gen2 への接続

ADLS Gen2 に接続してSASXpt ファイルを読み込むことができます。以下のプロパティを設定して接続します:

  • URI:ファイルシステムの名前およびSASXpt ファイルにコンタクトするフォルダの名前に設定。
  • AzureAccount:Azure Data Lake storage アカウントの名前に設定。
  • AzureAccessKey:Azure Data Lake storage Gen 2 ストレージアカウントのアクセスキーに設定。
  • TemporaryLocalFolder:SASXptファイルを一時的にダウンロードするために使用するフォルダへのパス、またはURI に設定。

スキーマ Discovery

ドライバーはSAS xpt API をリレーショナルデータベース、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデルします。次のコードを使ってテーブルリストを検出します。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使ってSAS xpt API がサポートするすべてのSQL クエリを実行できます:

sampletable_1 <- dbGetQuery(conn,"SELECT Id, Column1 FROM SampleTable_1 WHERE Column2 = '100'")

次のコマンドを使って、結果を[data viewer]ウィンドウで見ることができます。

View(sampletable_1)

SAS xpt Data をプロット

CRAN レポジトリで利用可能なあらゆるデータ初期化パッケージを使ってSAS xpt を分析する準備が整いました。ビルトインバーのplot 関数を使って簡単なバーを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(sampletable_1$Column1, main="SAS xpt SampleTable_1", names.arg = sampletable_1$Id, horiz=TRUE)