Cognos BI でFHIR のデータを使ってデータビジュアライゼーションを作成

こんにちは！ドライバー周りのヘルプドキュメントを担当している古川です。

CData ODBC Driver for FHIR を使って、FHIR のデータをドラッグアンドドロップ スタイルのCognos Report Studio に連携できます。この記事では、データビジュアライゼーションをSQL を書かずに作成するグラフィカルアプローチと、FHIR がサポートする任意のSQL クエリを実行する方法の両方について説明します。

CData ODBC ドライバとは？

CData ODBC ドライバは、以下のような特徴を持った製品です。

1. FHIR をはじめとする、CRM、MA、会計ツールなど多様なカテゴリの270種類以上のSaaS / オンプレデータソースに対応
2. 多様なアプリケーション、ツールにFHIR のデータを連携
3. ノーコードでの手軽な接続設定
4. 標準SQL での柔軟なデータ読み込み・書き込み

CData ODBC ドライバでは、1.データソースとしてFHIR の接続を設定、2.Cognos BI 側でODBC Driver との接続を設定、という2つのステップだけでデータソースに接続できます。以下に具体的な設定手順を説明します。

CData ODBC ドライバのインストールとFHIR への接続設定

まずは、本記事右側のサイドバーからFHIR ODBC Driver の無償トライアルをダウンロード・インストールしてください。30日間無償で、製品版の全機能が使用できます。

下記の手順に従って、［Cognos Administration］ツールのライブ FHIR に接続を確立します。この接続はCognos BI 全体で使えます。このドライバーを使って、すべてのユーザーは一貫したデータおよびメタデータ：リアルタイムFHIR を利用できます。

1. 接続プロパティの指定がまだの場合は、ODBC DSN （データソース名）で行います。Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターを使ってODBC DSN を作成および設定できます。

   64ビット版のマシンからCognos を実行している場合は、32ビット版ODBC データソースアドミニストレーターを起動する必要があります。以下のコマンドで開くことができます：

   C:\Windows\sysWOW64\odbcad32.exe

   URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

   汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

   Service Base URL のサンプル

   • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
   • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
   • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
   • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

   汎用FHIR インスタンス

   CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

   Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターで必要なプロパティを設定する方法は、ヘルプドキュメントの「はじめに」をご参照ください。

2. ［Cognos Administration］を開いて新しいデータソースを追加します。［Data Source Connections］をクリックして［ODBC］オプションを選択したら、システムDSN とユーザーフレンドリーな名前を入力します。Click Retrieve Objects and choose the CData FHIR database object.

   

Data Visualizations をレポートに追加

これで、［Source Explorer］からレポートオブジェクトにカラムをドラッグアンドドロップしてCognos Report Studio のFHIR のデータ にレポートを作成できます。以下では、最新データを表示するチャートを持つシンプルなレポートを作成する方法を説明します。

レポートをビルドすると、Cognos Report Studio はSQL クエリを生成して実行をドライバーに依存します。ドライバーはクエリをFHIR API へのリクエストに変換します。ドライバーはリアルタイムFHIR へのクエリの実行を基になるAPI に依存します。

アグリゲートに基づきチャートを作成

［Source Explorer］からオブジェクトのdimentions にカラムをドラッグアンドドロップするだけで、Cognos レポートオブジェクトとしてFHIR のデータを使うことができます。チャートのSeries dimension のカラムは自動的にグループ化されます。

さらにCognos は、measure dimesion のロジカルなデフォルトアグリゲート関数をデータタイプに基づいて設定します。この例では、デフォルトをオーバーライドしています。［Data Items］タブの [name-use] カラムをクリックしてAggregate Function プロパティを Not Applicableに設定します。Rollup Aggregate Function プロパティは Automatic に設定する必要があります。

Query オブジェクトをSQL に変換

必要なクエリを把握している、あるいは生成されたクエリを調整したい場合は、query オブジェクトをSQL ステートメントに変換します。クエリがSQL に変換されると、UI コントロールはquery オブジェクトで利用できなくなります。下記の手順に従って、ユーザー定義のSQL でチャートを埋めます。

Cognos はユーザー定義クエリの実行をドライバーに依存します。ドライバーのSQL エンジンを使うと、キャッシュデータのコピーがないためクエリは常に最新の結果を返します。

1. ［Query Explorer］の上にカーソルを置き、［Queries］フォルダをクリックしてレポートにquery オブジェクトを表示します。

2. 自動生成されたクエリを編集したい場合は、Generated SQL プロパティにあるquery オブジェクトのボタンをクリックします。ダイアログが表示されたら、［Convert］をクリックします。

   新たにSQL ステートメントを入力したい場合は、query オブジェクトと一緒にSQL オブジェクトをドロップします。

3. SQL オブジェクトのプロパティを編集：SQL プロパティでFHIR のデータソースを選択してSQL Syntax プロパティをNative に設定します。

4. SQL プロパティのボタンをクリックし、ダイアログが表示されたらSQL クエリを入力します。この例では以下のクエリを使います：

   SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'

5. query オブジェクトのプロパティを編集：Processing プロパティを［Limited Local］に設定します。この値はquery オブジェクトをSQL に変換するために必要です。

   

クエリ結果をチャートで使用

これで［Data Items］タブのオブジェクトとしてSQL クエリ結果にアクセスできるようになりました。下記の手順に従って、クエリ結果を使ってチャートを作成します；例えば、Patient テーブルから[name-use] を各Id へ。

1. ［Page Explorer］ 上にカーソルを置きpage オブジェクトをクリックしてページに戻ります。
2. 円グラフをツールボックスからワークスペース上にドラッグします。
3. チャートのプロパティで、Query プロパティに先ほど作成したクエリの名前を設定します。
4. ［Data Items］タブをクリックしてカラムをx およびy 軸上にドラッグします。この例ではId カラムをSeries (pie slices) ボックスに、[name-use] カラムをDefault Measure ボックスにドラッグします。

5. Default Measure ([name-use] 値) のデフォルトのプロパティを編集します：［Aggregate Function］ボックスで "Not Applicable" オプションを選択します。

レポートを実行してクエリ結果を追加します。