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FHIR ODBC ドライバーは、ODBC 接続をサポートする任意のアプリケーションからリアルタイムなFHIR アカウントデータに直接接続できるパワフルなツールです。標準のODBC ドライバーインタフェースを使用して、データベースのようにFHIR データにアクセスし、読み、書き、更新を実行できます。

Cognos BI でFHIR データを使ってデータビジュアライゼーションを作成

Cognos Business Intelligence のODBC データソースとしてFHIR にアクセスし、Cognos Report Studio でデータビジュアライゼーションを作成。

古川えりか
コンテンツスペシャリスト

最終更新日:2022-07-18
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CData

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IBM Cognos BI ロゴ

こんにちは!ドライバー周りのヘルプドキュメントを担当している古川です。



CData ODBC Driver for FHIR を使って、FHIR データをドラッグアンドドロップ スタイルのCognos Report Studio に連携できます。この記事では、データビジュアライゼーションをSQL を書かずに作成するグラフィカルアプローチと、FHIR がサポートする任意のSQL クエリを実行する方法の両方について説明します。

CData ODBC Drivers とは?

CData ODBC Drivers は、以下のような特徴を持った製品です。

  1. FHIR をはじめとする、CRM、MA、会計ツールなど多様なカテゴリの270種類以上のSaaS / オンプレデータソースに対応
  2. 多様なアプリケーション、ツールにFHIR データを連携
  3. ノーコードでの手軽な接続設定
  4. 標準SQL での柔軟なデータ読み込み・書き込み

CData ODBC Driver では、1.データソースとしてFHIR の接続を設定、2.Cognos BI 側でODBC Driver との接続を設定、という2つのステップだけでデータソースに接続できます。以下に具体的な設定手順を説明します。

CData ODBC Drivers のインストールとFHIR への接続設定

まずは、本記事右側のサイドバーからFHIR ODBC Driver の無償トライアルをダウンロード・インストールしてください。30日間無償で、製品版の全機能が使用できます。

下記の手順に従って、[Cognos Administration]ツールのライブ FHIR に接続を確立します。この接続はCognos BI 全体で使えます。このドライバーを使って、すべてのユーザーは一貫したデータおよびメタデータ:リアルタイムFHIR を利用できます。

  1. 接続プロパティの指定がまだの場合は、ODBC DSN (データソース名)で行います。Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターを使ってODBC DSN を作成および設定できます。

    64ビット版のマシンからCognos を実行している場合は、32ビット版ODBC データソースアドミニストレーターを起動する必要があります。以下のコマンドで開くことができます:

    C:\Windows\sysWOW64\odbcad32.exe

    URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

    汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

    Service Base URL のサンプル

    • 汎用:http://my_fhir_server/r4b/
    • Azure:https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
    • AWS:https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
    • Google:https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

    汎用FHIR インスタンス

    CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います(OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください)。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionTypeGenericに設定する必要があります。

    Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターで必要なプロパティを設定する方法は、ヘルプドキュメントの「はじめに」をご参照ください。

  2. [Cognos Administration]を開いて新しいデータソースを追加します。[Data Source Connections]をクリックして[ODBC]オプションを選択したら、システムDSN とユーザーフレンドリーな名前を入力します。Click Retrieve Objects and choose the CData FHIR database object.

    The DSN used to add the data source. (Salesforce is shown.)

Data Visualizations をレポートに追加

これで、[Source Explorer]からレポートオブジェクトにカラムをドラッグアンドドロップしてCognos Report Studio のFHIR データ にレポートを作成できます。以下では、最新データを表示するチャートを持つシンプルなレポートを作成する方法を説明します。

レポートをビルドすると、Cognos Report Studio はSQL クエリを生成して実行をドライバーに依存します。ドライバーはクエリをFHIR API へのリクエストに変換します。ドライバーはリアルタイムFHIR へのクエリの実行を基になるAPI に依存します。

アグリゲートに基づきチャートを作成

[Source Explorer]からオブジェクトのdimentions にカラムをドラッグアンドドロップするだけで、Cognos レポートオブジェクトとしてFHIR データを使うことができます。チャートのSeries dimension のカラムは自動的にグループ化されます。

さらにCognos は、measure dimesion のロジカルなデフォルトアグリゲート関数をデータタイプに基づいて設定します。この例では、デフォルトをオーバーライドしています。[Data Items]タブの [name-use] カラムをクリックしてAggregate Function プロパティを Not Applicableに設定します。Rollup Aggregate Function プロパティは Automatic に設定する必要があります。

FHIR columns used in a pie chart. (Salesforce is shown.)

Query オブジェクトをSQL に変換

必要なクエリを把握している、あるいは生成されたクエリを調整したい場合は、query オブジェクトをSQL ステートメントに変換します。クエリがSQL に変換されると、UI コントロールはquery オブジェクトで利用できなくなります。下記の手順に従って、ユーザー定義のSQL でチャートを埋めます。

Cognos はユーザー定義クエリの実行をドライバーに依存します。ドライバーのSQL エンジンを使うと、キャッシュデータのコピーがないためクエリは常に最新の結果を返します。

  1. [Query Explorer]の上にカーソルを置き、[Queries]フォルダをクリックしてレポートにquery オブジェクトを表示します。
  2. 自動生成されたクエリを編集したい場合は、Generated SQL プロパティにあるquery オブジェクトのボタンをクリックします。ダイアログが表示されたら、[Convert]をクリックします。

    新たにSQL ステートメントを入力したい場合は、query オブジェクトと一緒にSQL オブジェクトをドロップします。

  3. SQL オブジェクトのプロパティを編集:SQL プロパティでFHIR データソースを選択してSQL Syntax プロパティをNative に設定します。
  4. SQL プロパティのボタンをクリックし、ダイアログが表示されたらSQL クエリを入力します。この例では以下のクエリを使います:

    SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'
  5. query オブジェクトのプロパティを編集:Processing プロパティを[Limited Local]に設定します。この値はquery オブジェクトをSQL に変換するために必要です。

    A query object created from an SQL statement.

クエリ結果をチャートで使用

これで[Data Items]タブのオブジェクトとしてSQL クエリ結果にアクセスできるようになりました。下記の手順に従って、クエリ結果を使ってチャートを作成します;例えば、Patient テーブルから[name-use] を各Id へ。

  1. [Page Explorer] 上にカーソルを置きpage オブジェクトをクリックしてページに戻ります。
  2. 円グラフをツールボックスからワークスペース上にドラッグします。
  3. チャートのプロパティで、Query プロパティに先ほど作成したクエリの名前を設定します。
  4. [Data Items]タブをクリックしてカラムをx およびy 軸上にドラッグします。この例ではId カラムをSeries (pie slices) ボックスに、[name-use] カラムをDefault Measure ボックスにドラッグします。
  5. Default Measure ([name-use] 値) のデフォルトのプロパティを編集します:[Aggregate Function]ボックスで "Not Applicable" オプションを選択します。

A pie chart populated with the result of executing the SQL query. (Salesforce is shown.)

レポートを実行してクエリ結果を追加します。

The rendered report. (Salesforce is shown.)

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