JDBC データソースでFHIR との間にInformatica マッピングを作成

こんにちは！ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。

Informatica は、データを転送・変換するための強力で立派な手段を提供します。CData JDBC Driver for FHIR を利用することで、Informatica の強力なデータ転送および操作機能とシームレスに統合される、業界で実証済みの標準に基づくドライバーにアクセスできます。このチュートリアルでは、Informatica PowerCenter でFHIR を転送および参照する方法を示します。

ドライバーをデプロイ

ドライバーをInformatica PowerCenter サーバーに展開するために、インストールディレクトリのlib サブフォルダにあるCData JAR および.lic ファイルを次のフォルダにコピーします。Informatica-installation-directory\services\shared\jars\thirdparty.

Developer ツールでFHIR を使用するには、インストールディレクトリのlib サブフォルダにあるCData JAR および.lic ファイルを次のフォルダにコピーする必要があります。

• Informatica-installation-directory\client\externaljdbcjars
• Informatica-installation-directory\externaljdbcjars

JDBC 接続の作成

以下のステップに従って、Informatica Developer に接続します。

1. ［Connection Explorer］ペインで［domain］を右クリックし、［Create a Connection］をクリックします。
2. 表示される［New Database Connection］ウィザードで、接続の名前とId を入力し、［Type］メニューで［JDBC］を選択します。
3. ［JDBC Driver Class Name］のプロパティで次のコードを入力します。 cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver
4. ［Connection String］プロパティでは、FHIR の接続プロパティを使用してJDBC URLを入力します。

   URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

   汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

   Service Base URL のサンプル

   • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
   • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
   • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
   • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

   汎用FHIR インスタンス

   CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

   ビルトイン接続文字列デザイナ

   JDBC URL の構成については、FHIR JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナを使用してください。JAR ファイルのダブルクリック、またはコマンドラインからJAR ファイルを実行します。

   java -jar cdata.jdbc.fhir.jar

   接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。

   以下は一般的な接続文字列です。

   jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;

FHIR テーブルを参照

ドライバーJAR をクラスパスに追加してJDBC 接続を作成すると、Informatica のFHIR エンティティにアクセスできるようになります。以下のステップに従ってFHIR に接続し、FHIR テーブルを参照します。

1. リポジトリに接続します。
2. ［Connection Explorer］で、［connection］を右クリックし、［Connect］をクリックします。
3. ［Show Default Schema Only］オプションをクリアします。

以下より、［Data Viewer］でFHIR テーブルを参照できるようになります。テーブルの［node］を右クリックし、［Open］をクリックします。［Data Viewer］で［Run］をクリックします。

FHIR データオブジェクトの作成

以下のステップに従って、プロジェクトにFHIR テーブルを追加します。

1. FHIR でテーブルを選択し、右クリックして［Add to Project］をクリックします。
2. 表示されるダイアログでリソースごとにデータオブジェクトを作成するオプションを選択します。
3. ［Select Location］ダイアログで、プロジェクトを選択します。

   マッピングの作成

   以下のステップに従って、マッピングにFHIR ソースを追加します。

   1. ［Object Explorer］でプロジェクトを右クリックし、［New］->［Mapping］と進みます。
   2. FHIR 接続のノードを展開し、テーブルのデータオブジェクトをエディターにドラッグします。.
   3. 表示されるダイアログで、［Read］オプションを選択します。

   以下のステップに従って、FHIR カラムをフラットファイルにマッピングします。

   1. ［Object Explorer］でプロジェクトを右クリックし、［New］->［Data Object］と進みます。
   2. ［Flat File Data Object］->［Create as Empty］->［Fixed Width］と選択していきます。
   3. FHIR オブジェクトのプロパティで必要な行を選択して右クリックし、［copy］をクリックします。行をフラットファイルのプロパティにペーストします。
   4. フラットファイルのデータオブジェクトをマッピングにドラッグします。
   5. 表示されるダイアログで、［Write］オプションを選択します。
   6. クリックしてドラッグすることで、列を接続します。

   FHIR を転送するために、ワークスペースで右クリックし、［Run Mapping］をクリックします。