Jetty コネクションプールからFHIR データに連携。

こんにちは！ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。

CData JDBC Driver for FHIR は、Java Web アプリケーションに簡単に統合して利用することができます。本記事では、Jetty でドライバーをコネクションプールとして設定することで、効率的にFHIR データをアプリケーションで連携利用する方法を説明します。Jetty でJNDI resource for FHIR を設定します。

DBC Driver for FHIR を JNDI Data Source として設定

次の手順で、Jetty とFHIR の接続を確立します。

1. Jetty ベースでJNDI モジュールを有効化します。JNDI を有効化するコマンドラインは以下の通り:

   java -jar ../start.jar --add-to-startd=jndi
2. JDBC Driver の.jar ファイルと.lic ファイル（インストールディレクトリのlib フォルダ下）をcontext path のlib フォルダに配置します。
3. リソースおよびスコープを宣言します。リソース宣言で必要な接続プロパティを入力します。この例では、FHIR データソースをWeb アプリケーションのWEB-INF\jetty-env.xml レベルにdeclare しています。
   <Configure id='fhirdemo' class="org.eclipse.jetty.webapp.WebAppContext"> <New id="fhirdemo" class="org.eclipse.jetty.plus.jndi.Resource"> <Arg><Ref refid="fhirdemo"/></Arg> <Arg>jdbc/fhirdb</Arg> <Arg> <New class="cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver"> <Set name="url">jdbc:fhir:</Set> <Set name="URL">http://test.fhir.org/r4b/</Set> <Set name="ConnectionType">Generic</Set> <Set name="ContentType">JSON</Set> <Set name="AuthScheme">None</Set> </New> </Arg> </New> </Configure>

   URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

   汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

   Service Base URL のサンプル

   • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
   • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
   • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
   • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

   汎用FHIR インスタンス

   CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

4. Web xml でリソースを設定します:

   jdbc/fhirdb javax.sql.DataSource Container

5. これで、java:comp/env/jdbc/fhirdb へのルックアップでFHIR データにアクセスできます: InitialContext ctx = new InitialContext(); DataSource myfhir = (DataSource)ctx.lookup("java:comp/env/jdbc/fhirdb");

Jetty にさらに統合

ここでは、シンプルなコネクションプーリングシナリオでのドライバーの接続について説明しました。追加での連携ケースについては、Jetty ドキュメントのWorking with Jetty JNDI 　参照してください。