JReport Designer でFHIR データを連携

こんにちは！ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。

CData JDBC Driver for FHIR を使用すると、FHIR がリレーショナルデータベースであるかのようにダッシュボードやレポートからリアルタイムデータにアクセスでき、使い慣れたSQL クエリを使用してFHIR] をクエリできます。ここでは、JDBC データソースとしてFHIR に連携し、JReport Designer でFHIR のレポートを作成する方法を説明します。

FHIR データに接続

1. C:\JReport\Designer\bin\setenv.bat を編集し、JAR ファイルの場所をADDCLASSPATH 変数に追加します。

   ...
   set ADDCLASSPATH=%JAVAHOME%\lib\tools.jar;C:\Program Files\CData\CData JDBC Driver for FHIR 2016\lib\cdata.jdbc.fhir.jar;
   ...
   

2. ［File］［New］［Data Source］と進み、新しいデータソースを作成します。
3. 表示されるダイアログで、データソースの名前(CData JDBC Driver for FHIR) を作成し、JDBC を選択して［OK］をクリックします。
4. ［JDBC Connection Information］ダイアログで、JDBC ドライバーへの接続を構成します。
   • Driver:［Driver］ボックスにチェックがついていることを確認し、ドライバーのクラスの名前を入力します。 cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver
   • URL:jdbc:fhir: から始まり、その後にセミコロンで区切られた接続プロパティのリストが続くJDBC URL を入力します。

     URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

     汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

     Service Base URL のサンプル

     • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
     • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
     • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
     • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

     汎用FHIR インスタンス

     CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

     ビルトイン接続文字列デザイナー

     JDBC URL の構成については、FHIR JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーを使用してください。JAR ファイルのダブルクリック、またはコマンドラインからJAR ファイルを実行します。

     java -jar cdata.jdbc.fhir.jar

     接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。

     JDBC URL を構成する際、Max Rows 接続プロパティを設定することもできます。これによって戻される行数を制限するため、可視化・レポートのデザイン設計時のパフォーマンスを向上させるのに役立ちます。

     以下は一般的なJDBC URLです。

     jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;
   • User:認証に使用するユーザー名は、通常空白のままにします。
   • Password:User と同様に認証に使用するパスワードも、通常は空白のままにします。

5. ［Add Table］ダイアログで、レポート（またはこのデータソースを使用する予定のレポート）に含めるテーブルを選択し、［Add］をクリックします。

   ダイアログがテーブルのロードを完了したら、［Done］をクリックします。

6. ［Catalog Browser］では、レポートの作成に使用するクエリを作成できます。今すぐ、またはレポートの作成後に作成できますが、どちらにしても、 データソース(CData JDBC Driver for FHIR) を展開()し、［Queries］を右クリックして［Add Query］を選択します。
7. ［Add Table/View/Query］ダイアログで、JDBC URL とTables を展開() し、クエリで使用するテーブルを選択して［OK］をクリックします。
8. ［Query Editor］ダイアログで、含めるカラムを選択するか、［SQL］ボタンをクリックして以下のようにカスタムクエリを手動で入力できます。

   SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'
   

   クエリが作成されたら、［OK］をクリックして［Query Editor］ダイアログを閉じます。この時点で、FHIR を新規または既存のレポートに追加する準備が整いました。

   NOTE: クエリが作成されると、クエリに基づいて［Business View］を作成できます。［Business View］を使用すると、クエリに基づいてWeb レポートまたはライブラリコンポーネントを作成できます。これについてのより詳しい情報は、JReport のチュートリアルを参照してください。

レポートにFHIR データを追加

FHIR を使用してレポートを作成することができるようになりました。

1. 新しいレポートを作成(［File］［New］［Page Report］) するか、既存のレポートの［Chart Wizard］を開きます。
2. クエリを選択(または上記を参照して新しいクエリを作成) します。
3. クエリのカラムからグラフの［Category］と［Value］を割り当て、［Finish］をクリックします。
4. レポートの［View］タブをクリックし、チャートを表示します。