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MySQL データをR で分析

データビジュアライゼーション、ハイパフォーマンスな統計関数を使ってMySQL をMicrosoft R Open で分析。



Pure R スクリプトおよび 標準SQL を使ってMySQL にアクセス。CData ODBC Driver for MySQL とRODBC package を使って、R でリモートMySQL を利用できます。CData Driver を使うことで、オープンソースでポピュラーなR 言語のデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってMySQL にSQL クエリを実行する方法、およびR でMySQL をビジュアライズする方法について説明します。

R をインストール

マルチスレッドのMicrosoft R Open を実行すること、またはBLAS/LAPACK ライブラリにリンクされたオープンR を実行することによって、マルチスレッドおよびマネージドコードからドライバーのパフォーマンスにマッチできます。ここでは、Microsoft R Open 3.2.3 を使用します。CRAN レポジトリのJan. 1, 2016 snapshot からパッケージをインストールするために事前設定されています。このsnapshot は再現性を保証します。

MySQL ODBC Data Source としてMySQL に連携

接続プロパティの指定がまだの場合は、まずODBC DSN (データソース名)で接続設定を行います。これはドライバーのインストール時に自動的に立ち上がります。Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターを使ってODBC DSN を作成および設定できます。

Server およびPort プロパティがMySQL への接続には比っすです。IntegratedSecurity をFALSE に設定した場合、User、Password も必須になります。 オプションで、Database を設定することもできます。Database は設定がない場合すべてのデータベースを使えるようになります。

RODBC パッケージをロード

ドライバーを使うにはRODBC パッケージをダウンロードします。RStudio で[Tools]>[Install Packages]をクリックし、RODBC を[Packages]ボックスに入力します。

RODBC パッケージをインストールしたら、次のコードを入力してパッケージをロードします。

library(RODBC)

ODBC データソースとしてMySQL データに連携

次のコードを使ってR のDSN に接続できます:

conn <- odbcConnect("CData MySQL Source")

スキーマ検出

ドライバーはMySQL API をリレーショナルデータベース、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデル化します。次のコードを使ってテーブルリストを検出します。

sqlTables(conn)

SQL クエリの実行

sqlQuery 関数を使ってMySQL API がサポートするすべてのSQL クエリを実行します。

orders <- sqlQuery(conn, "SELECT ShipName, Freight FROM Orders", believeNRows=FALSE, rows_at_time=1)

次のコマンドを使って、結果を[data viewer]ウィンドウで見ることができます。

View(orders)

MySQL データをプロット

これで、CRAN レポジトリで利用可能なあらゆるデータビジュアライゼーションパッケージを使ってMySQL を分析できます。ビルトインのbar plot 関数を使って簡単なバーを作成できます:

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(orders$Freight, main="MySQL Orders", names.arg = orders$ShipName, horiz=TRUE)
 
 
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